Jepang melanjutkan dominasinya di babak kedua. Hidemasa Morita mencetak gol ketiga pada menit ke-48 memanfaatkan kesalahan Paes yang salah mengoper bola di depan kotak penalti. Morita dengan tenang mengecoh Justin Hubner sebelum melepaskan tembakan ke tiang jauh.
Indonesia seakan tak mampu mengimbangi permainan tim Jepang hingga sempat mendapatkan beberapa peluang untuk memperkecil skor, salah satunya dari Calvin Verdonk di menit ke-53 dan Idzes di menit ke-57, tetapi usaha mereka gagal menghasilkan gol.
Gol penutup Jepang dicetak Yukinari Sugawara pada menit ke-69. Aksi individunya yang melewati Nathan Tjoe-A-On di sisi kanan diakhiri dengan tembakan keras ke pojok atas gawang.
Di sisa waktu, Timnas Indonesia mencoba bangkit. Ragnar Oratmangoen dan Pratama Arhan sempat mendapat peluang, tetapi upaya mereka dengan mudah dihentikan lini pertahanan Jepang. Hingga peluit panjang dibunyikan, skor 4-0 tetap bertahan untuk kemenangan Jepang.
Kekalahan ini menjadi evaluasi besar dan semakin terpuruk untuk bisa lolos bagi Timnas Indonesia, terutama dalam menjaga konsistensi permainan dan memanfaatkan peluang. Selanjutnya, Garuda akan menghadapi laga sulit lainnya di putaran ketiga Kualifikasi Piala Dunia 2026.
