Bagian depan Panigale V2 menampilkan karakter kuat yang merujuk pada Panigale V4, didominasi oleh lampu depan Full-LED dan DRL (Daytime Running Light) yang hampir horizontal, serta ditutup di bagian bawah oleh tepian depan yang menjadi salah satu ciri style baru dari desain depan Panigale. Desain tangki bahan bakar, yang dirancang untuk memberikan dukungan optimal kepada pengendara saat berkendara sporty, juga mengingatkan pada Panigale V4 terbaru, namun telah disesuaikan dengan basis mekanis baru serta perbedaan segitiga ergonomi, yang dikembangkan untuk mengurangi beban pada pergelangan tangan sambil tetap menjaga rasa kontrol yang luar biasa pada bagian depan saat menikung.
Bagian belakang, yang sepenuhnya dilapisi fairing seperti pada Desmosedici MotoGP, menciptakan efek monolitik antara jok dan buritan. Lampu belakang Full-LED dibagi menjadi dua bagian sesuai dengan tradisi motor sport Ducati. Knalpot, yang berakhir dengan silencer diposisikan di bawah jok, mengingatkan kembali pada tradisi balap Panigale, semakin menegaskan jiwa sporty dari motor ini.